Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCSER1Q9C0I3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms