Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCP2Q9BX26 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms