Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HIRIP3Q9BW71 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms