Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL13Q99616 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL13Q99616 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL13Q99616 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL13Q99616 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL13Q99616 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL13Q99616 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL13Q99616 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL13Q99616 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL13Q99616 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL13Q99616 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms