Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms