Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms