Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TSLPQ969D9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSLPQ969D9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms