Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
BRK1Q8WUW1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms