Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL34Q8N239 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL34Q8N239 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms