Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM72Q6ZMU5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms