Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms