Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC27Q2M243 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms