Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms