Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIX1Q15475 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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