Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 515.35■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 311.67□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 511.44□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 211.21□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 411.02□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 510.32□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 29.37□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 49.2□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.342e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 212.42□□□□□ -0.423e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 211.64□□□□□ -0.553e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.184e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-213ENST00000532085 5862 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.074e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.184e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 513.84□□□□□ -0.194e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-205ENST00000525102 2844 ntTSL 213.77□□□□□ -0.24e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.224e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-220ENST00000638925 2046 ntTSL 513.35□□□□□ -0.274e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-218ENST00000638186 2074 ntTSL 513.08□□□□□ -0.324e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-210ENST00000527992 2040 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.414e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SLC37A4-208ENST00000526275 2626 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.64e-15■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.143e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.825e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.045e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.215e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.365e-8■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 24e-12■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.184e-12■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-7■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 D2HGDH-208ENST00000445308 955 ntTSL 218.27■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 25.6
PCBP2Q15366 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-13■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 MINK1-212ENST00000576037 770 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-13■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-13■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.731e-13■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.121e-13■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.531e-13■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.882e-6■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.266e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GRN-205ENST00000586443 1557 ntTSL 318.51■□□□□ 0.551e-323■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-323■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GRN-204ENST00000586242 665 ntTSL 315.11■□□□□ 0.011e-323■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-323■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.836e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.446e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-8■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 RERE-216ENST00000505225 533 ntTSL 26.35□□□□□ -1.396e-8■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.092e-34■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 FNDC3B-208ENST00000476794 682 ntTSL 37.73□□□□□ -1.178e-10■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 IFITM3-203ENST00000531688 500 ntTSL 39.61□□□□□ -0.872e-38■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 ATP1A1-208ENST00000488733 1728 ntTSL 219.83■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 318.27■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.054e-8■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 59.78□□□□□ -0.848e-8■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.353e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.593e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.623e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.318e-7■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 CLSTN3-202ENST00000331148 2288 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.43e-9■■■■□ 25.5
PCBP2Q15366 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.074e-8■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SUPT5H-211ENST00000598459 548 ntTSL 58.26□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SUPT5H-205ENST00000593727 493 ntTSL 36.61□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.358e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 45.98□□□□□ -1.453e-10■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 44.73□□□□□ -1.653e-10■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ITGA2-203ENST00000509814 3487 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ITGA2-206ENST00000513685 3501 ntTSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ITGA2-204ENST00000509960 3674 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ITGA2-205ENST00000510722 3530 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.114e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.284e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 318.33■□□□□ 0.521e-55■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 TGFBR3-206ENST00000470600 574 ntTSL 28.29□□□□□ -1.084e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 TRIP12-202ENST00000343290 583 ntTSL 317.27■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.461e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.855e-7■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.899e-9■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.849e-9■■■■□ 25.4
PCBP2Q15366 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.839e-9■■■■□ 25.4
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