Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD1Q15327 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD1Q15327 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD1Q15327 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD1Q15327 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD1Q15327 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms