Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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PCM1Q15154 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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