Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL4A6Q14031 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms