Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK13Q14004 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK13Q14004 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK13Q14004 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK13Q14004 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK13Q14004 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms