Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms