Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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