Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRDNQ13061 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRDNQ13061 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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