Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLE4Q04727 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms