Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OCA2Q04671 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.6 ms