Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCN7AQ01118 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms