Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX6-1P78426 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX6-1P78426 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms