Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRX6P78412 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRX6P78412 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRX6P78412 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms