Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZA1P52907 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZA1P52907 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZA1P52907 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPZA1P52907 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms