Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms