Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PGDP52209 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PGDP52209 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGDP52209 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGDP52209 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGDP52209 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms