Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms