Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATA4P43694 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GATA4P43694 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GATA4P43694 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GATA4P43694 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms