Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CXCL3P19876 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL3P19876 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL3P19876 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL3P19876 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms