Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIGD3P0DMS9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms