Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC1P02654 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC1P02654 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOC1P02654 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms