Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA3O96018 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APBA3O96018 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APBA3O96018 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APBA3O96018 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms