Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms