Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F3O00716 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms