Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1D1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1D1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1D1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H7C1D1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H7C1D1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H7C1D1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H7C1D1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1D1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms