Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALD1Q9ULE6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PALD1Q9ULE6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms