Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL9Q9P2J3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms