Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms