Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRDM8Q9NQV8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms