Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITX2Q99697 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms