Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM3Q96MX0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms