Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms