Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms