Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC8Q96B26 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms