Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXT2Q93063 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms