Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms